میلاد غفوری- ۱۳۹۹/۰۳/۱۱

ارائه­ دهنده:

  استاد راهنما:

 دکتر عادل رحمانی

هیات داوران:
دکتر کاوه کاووسی ، دکتر مینایی

زمان:
یکشنبه ۱۳۹۹/۰۳/۱۱

ساعت ۱۴:۰۰
 
 

آقای میلاد غفوری   دانشجوی کارشناسی ارشد آقای دکتر عادل رحمانی یکشنبه  ۱۱ خردادماه ساعت  ۱۴:۰۰  از پروژه کارشناسی ارشد خود  تحت عنوان "استفاده از روش‌های بازنمایی برداری پیوسته در توالی‌یابی ژنوم" دفاع خواهند نمود.

چکیده پایان نامه:
دنباله‌های زیستی حاوی اطلاعاتی هستند که باید از آنها در عملیاتی نظیر دسته بندی و انطباق و توالی‌یابی و غیره بهره برد. استخراج این اطلاعات و استفاده از آنها در عملیات مذکور پیچیده و زمانبر است. با بازنمایی مناسب این دنباله‌‌ها می‌توان درک و محاسبه‌ی آنها را ساده‌تر کرد.
امروزه با رشد سریع داده‌های بیوانفورماتیکی روش‌های یادگیری ماشین در زمینه‌های متعددی از بیوانفورماتیک کاربرد یافته‌اند. ژنومیک یکی از حوزه‌های بسیار مهم بیوانفورماتیک است که با ظهور تکنولوژی «توالی‌یابی نسل جدید» تعداد دنباله‌های موجود در آن بصورت نمایی در حال افزایشند. در گذشته برای تحلیل این دنباله‌ها نیاز به دانش و مطالعات پایه‌ای برای توصیف آنها بود.
با استفاده از مدل‌های یادگیری ماشین می‌توان هر دنباله‌ی زیستی را بصورت یک بردار n بعدی که خصوصیات بیوفیزیکی و بیوشیمیایی آن را مشخص می‌کند بازنمایی کرد که این بازنمایی را می‌توان در طیف گسترده‌ای از مسائل بیوانفورماتیک نظیر دسته‌بندی پروتئین‌ها و تشخیص ساختار به کار برد. به همین انگیزه در این تحقیق تاثیر به کارگیری بازنمایی برداری در عملیات «توالی‌یابی» را نشان خواهیم داد.

  دانشکده مهندسی کامپیوتر مدیریت تحصیلات تکمیلی